INSTALL
LICENSE
MANIFEST.in
README
setup.py
fastsemsim/__init__.py
fastsemsim/fastsemsim_cmdline.py
fastsemsim/version
fastsemsim.egg-info/PKG-INFO
fastsemsim.egg-info/SOURCES.txt
fastsemsim.egg-info/dependency_links.txt
fastsemsim.egg-info/entry_points.txt
fastsemsim.egg-info/requires.txt
fastsemsim.egg-info/top_level.txt
fastsemsim/Ontology/AnnotationCorpus.py
fastsemsim/Ontology/CellOntology.py
fastsemsim/Ontology/DiseaseOntology.py
fastsemsim/Ontology/FFOntology.py
fastsemsim/Ontology/GAF2AnnotationCorpus.py
fastsemsim/Ontology/GOAnnotationCorpus.py
fastsemsim/Ontology/GeneOntology.py
fastsemsim/Ontology/Ontology.py
fastsemsim/Ontology/PlainAnnotationCorpus.py
fastsemsim/Ontology/__init__.py
fastsemsim/Ontology/ontologies.py
fastsemsim/SemSim/BMASemSim.py
fastsemsim/SemSim/CosineSemSim.py
fastsemsim/SemSim/CzekanowskiDiceSemSim.py
fastsemsim/SemSim/DiceSemSim.py
fastsemsim/SemSim/GSESAMESemSim.py
fastsemsim/SemSim/JaccardSemSim.py
fastsemsim/SemSim/JiangConrathSemSim.py
fastsemsim/SemSim/LinSemSim.py
fastsemsim/SemSim/MixSemSim.py
fastsemsim/SemSim/ObjSemSim.py
fastsemsim/SemSim/ObjSetSemSim.py
fastsemsim/SemSim/ResnikSemSim.py
fastsemsim/SemSim/SemSimUtils.py
fastsemsim/SemSim/SetSemSim.py
fastsemsim/SemSim/SimGICSemSim.py
fastsemsim/SemSim/SimICNDSemSim.py
fastsemsim/SemSim/SimICNPSemSim.py
fastsemsim/SemSim/SimICSemSim.py
fastsemsim/SemSim/SimNTOSemSim.py
fastsemsim/SemSim/SimRelSemSim.py
fastsemsim/SemSim/SimTOSemSim.py
fastsemsim/SemSim/SimUISemSim.py
fastsemsim/SemSim/TermSemSim.py
fastsemsim/SemSim/__init__.py
fastsemsim/SemSim/avgSemSim.py
fastsemsim/SemSim/maxSemSim.py
fastsemsim/SemSim/old_SemSim.py
fastsemsim/SemSim/old_SemSimMeasures.py
fastsemsim/data/.DS_Store
fastsemsim/data/__init__.py
fastsemsim/data/__init__.pyc
fastsemsim/data/dataset.py
fastsemsim/data/dataset.pyc
fastsemsim/data/dataset.txt
fastsemsim/data/parser.pyc
fastsemsim/data/ACs/DO_human_Osborne_BMC_2010.08.24.txt
fastsemsim/data/ACs/DO_human_Peng_NAR_2014.10.12.txt
fastsemsim/data/ACs/GO_gene_association.goa_arabidopsis_2014.10.12.gz
fastsemsim/data/ACs/GO_gene_association.goa_fly_2014.10.12.gz
fastsemsim/data/ACs/GO_gene_association.goa_human_2014.10.12.gz
fastsemsim/data/ACs/GO_gene_association.goa_mouse_2014.10.12.gz
fastsemsim/data/ACs/GO_gene_association.goa_rat_2014.10.12.gz
fastsemsim/data/ACs/GO_gene_association.goa_worm_2014.10.12.gz
fastsemsim/data/ACs/GO_gene_association.goa_zebrafish_2014.10.12.gz
fastsemsim/data/Os/CellOntology_2014.10.13.obo
fastsemsim/data/Os/DiseaseOntology_2014.10.13.obo
fastsemsim/data/Os/GeneOntology_2014.10.13.obo-xml.gz
fastsemsim/data/Os/GeneOntology_2014.10.27.obo
fastsemsim/data/Os/pato_2014.09.09.obo
fastsemsim/data/input_dataset_processing/.DS_Store
fastsemsim/data/input_dataset_processing/DOA.sh
fastsemsim/data/input_dataset_processing/GOA.sh
fastsemsim/data/input_dataset_processing/Os.sh
fastsemsim/examples/.A.swp
fastsemsim/examples/.B.swp
fastsemsim/examples/.DS_Store
fastsemsim/examples/README
fastsemsim/examples/__init__.py
fastsemsim/examples/__init__.pyc
fastsemsim/examples/example_cmdline.sh
fastsemsim/examples/example_cmdline_params.txt
fastsemsim/examples/load_annotation_corpus.py
fastsemsim/examples/load_annotation_corpus.pyc
fastsemsim/examples/load_ontology.py
fastsemsim/examples/load_ontology.pyc
fastsemsim/examples/data/DO_list_objset_query.txt
fastsemsim/examples/data/DO_list_query.txt
fastsemsim/examples/data/GO_fly_list_query.txt
fastsemsim/examples/data/GO_fly_pairs_query.txt